Also ich bin nicht der Meinung, dass Linux auf einem CarPC viel Sinn macht.
Es gibt wohl ein paar Projekte fĂĽr CarPC Software auf Linux, aber damit habe ich keine Erfahrung.
Vor allem mit Treibern wirst du große Probleme bekommen auf Linux für jegliche Peripherien (je nachdem was du alles anstöpseln möchtest).
Zumal man auch Windows auf einem USB-Stick laufen lassen könnte, aber von der Performance her macht das ebenso wenig Sinn (auch mit Linux auf einem USB Stick wirst du keine Freude haben).
Eine SSD ist aktuell die beste Wahl.
Bzgl. Abmessungen: Eine 2,5" SSD ist doch auch nicht wirklich groĂź.
Alternativ kannst du auch eine 1,8" SSD nehmen, die hat nur 78.5 (L) x 54 (W) x 5mm (H).
Beispiel:
http://geizhals.at/deutschland/a585456.html
Aber aus Erfahrung (hatte mal einen CarPC im Handschuhfach eines 3er Golf) muss ich dir sagen, dass du den CarPC besser nicht irgendwo reinquetschen solltest.
Damit wirst du nicht glücklich, weil es ein ständiges Gefriemel mit den Kabeln ist, da du nirgendwo richtig drankommst.